Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM2P07951 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM2P07951 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM2P07951 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM2P07951 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM2P07951 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM2P07951 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM2P07951 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM2P07951 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM2P07951 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM2P07951 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM2P07951 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM2P07951 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM2P07951 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM2P07951 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM2P07951 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM2P07951 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM2P07951 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM2P07951 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM2P07951 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM2P07951 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM2P07951 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM2P07951 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM2P07951 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM2P07951 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM2P07951 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM2P07951 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM2P07951 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM2P07951 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM2P07951 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM2P07951 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.5 ms