Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD6O43541 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms