Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARID3CA6NKF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARID3CA6NKF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms