Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms