Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD3Q9UJU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD3Q9UJU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms