Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIPK3Q9H422 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK3Q9H422 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIPK3Q9H422 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms