Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms