Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA3Q99618 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms