Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC16BQ96JE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16BQ96JE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms