Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC2Q92769 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC2Q92769 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC2Q92769 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC2Q92769 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC2Q92769 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC2Q92769 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms