Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms