Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SURF2Q15527 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SURF2Q15527 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms