Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRSF5Q13243 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF5Q13243 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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