Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBA4P53673 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms