Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3P39023 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3P39023 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3P39023 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3P39023 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3P39023 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3P39023 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3P39023 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3P39023 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL3P39023 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL3P39023 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3P39023 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3P39023 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3P39023 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3P39023 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3P39023 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3P39023 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL3P39023 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3P39023 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms