Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGP37231 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGP37231 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGP37231 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGP37231 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGP37231 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGP37231 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGP37231 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGP37231 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGP37231 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGP37231 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGP37231 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGP37231 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGP37231 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms