Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXP28300 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXP28300 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXP28300 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXP28300 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXP28300 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXP28300 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXP28300 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXP28300 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXP28300 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXP28300 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXP28300 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXP28300 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXP28300 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXP28300 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXP28300 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXP28300 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXP28300 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXP28300 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXP28300 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXP28300 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXP28300 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXP28300 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXP28300 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXP28300 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXP28300 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXP28300 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXP28300 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXP28300 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXP28300 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXP28300 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms