Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPBP14678 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms