Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSO75390 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSO75390 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSO75390 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSO75390 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSO75390 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSO75390 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSO75390 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSO75390 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSO75390 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSO75390 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSO75390 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSO75390 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSO75390 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSO75390 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSO75390 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSO75390 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSO75390 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSO75390 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSO75390 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSO75390 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSO75390 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSO75390 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSO75390 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSO75390 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSO75390 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSO75390 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSO75390 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSO75390 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSO75390 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSO75390 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSO75390 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSO75390 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSO75390 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSO75390 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSO75390 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSO75390 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSO75390 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSO75390 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSO75390 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSO75390 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSO75390 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSO75390 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms