Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX15Q9NRS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms