Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARD6AQ9NPB6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms