Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms