Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF2Q99496 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF2Q99496 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms