Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms