Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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SAMD8Q96LT4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD8Q96LT4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SAMD8Q96LT4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SAMD8Q96LT4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SAMD8Q96LT4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SAMD8Q96LT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SAMD8Q96LT4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SAMD8Q96LT4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SAMD8Q96LT4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SAMD8Q96LT4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD8Q96LT4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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