Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF549Q6P9A3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms