Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC39A4Q6P5W5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A4Q6P5W5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A4Q6P5W5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms