Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN3Q13064 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKRN3Q13064 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MKRN3Q13064 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKRN3Q13064 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKRN3Q13064 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MKRN3Q13064 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN3Q13064 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN3Q13064 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MKRN3Q13064 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN3Q13064 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN3Q13064 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN3Q13064 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN3Q13064 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKRN3Q13064 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKRN3Q13064 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN3Q13064 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN3Q13064 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MKRN3Q13064 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MKRN3Q13064 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN3Q13064 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN3Q13064 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MKRN3Q13064 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN3Q13064 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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