Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN11Q06124 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN11Q06124 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms