Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.665e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 DYNC1I2-205ENST00000409453 2552 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 DYNC1I2-223ENST00000479806 1798 ntTSL 25.31□□□□□ -1.565e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 DYNC1I2-224ENST00000482454 2590 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.575e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.74e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.384e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.74e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 210.4□□□□□ -0.744e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.284e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 MRPS18B-208ENST00000472267 1610 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.045e-13■■■■■ 40.8
SUB1P53999 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-13■■■■■ 40.8
SUB1P53999 MRPS18B-207ENST00000472229 1409 ntTSL 36.99□□□□□ -1.295e-13■■■■■ 40.8
SUB1P53999 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.847e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.127e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.137e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 TP53BP1-212ENST00000476454 2222 ntTSL 27.46□□□□□ -1.227e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 TP53BP1-204ENST00000411772 3976 ntTSL 57.28□□□□□ -1.247e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 40.8
SUB1P53999 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.011e-6■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.315e-26■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.355e-26■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.425e-26■■■■■ 40.8
SUB1P53999 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.475e-26■■■■■ 40.8
SUB1P53999 RPA1-206ENST00000573994 844 ntTSL 27.46□□□□□ -1.226e-12■■■■■ 40.8
SUB1P53999 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 40.7
SUB1P53999 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 40.7
SUB1P53999 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.547e-11■■■■■ 40.7
SUB1P53999 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.817e-11■■■■■ 40.7
SUB1P53999 POLR2B-208ENST00000478188 3093 ntTSL 23.1□□□□□ -1.917e-11■■■■■ 40.7
SUB1P53999 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.927e-11■■■■■ 40.7
SUB1P53999 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.726e-10■■■■■ 40.7
SUB1P53999 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.436e-10■■■■■ 40.7
SUB1P53999 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.446e-10■■■■■ 40.7
SUB1P53999 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 511.83□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 40.7
SUB1P53999 SPG21-209ENST00000559199 2059 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.146e-10■■■■■ 40.7
SUB1P53999 KPNA2-204ENST00000582898 394 ntTSL 33.87□□□□□ -1.793e-7■■■■■ 40.6
SUB1P53999 FBXO7-204ENST00000425028 1921 ntTSL 516.59■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 40.5
SUB1P53999 FBXO7-203ENST00000420700 1900 ntTSL 513.9□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 40.5
SUB1P53999 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 40.5
SUB1P53999 FBXO7-209ENST00000492535 6884 ntTSL 56.53□□□□□ -1.364e-8■■■■■ 40.5
SUB1P53999 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.534e-8■■■■■ 40.5
SUB1P53999 YWHAQ-205ENST00000474715 709 ntTSL 33.01□□□□□ -1.933e-13■■■■■ 40.4
SUB1P53999 CHURC1-207ENST00000556089 571 ntTSL 23.98□□□□□ -1.776e-7■■■■■ 40.4
SUB1P53999 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 HSPD1-203ENST00000418022 533 ntTSL 413.96□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 SUPT4H1-205ENST00000581166 1401 ntTSL 210.56□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 PEF1-202ENST00000461006 732 ntTSL 59.07□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 PEF1-205ENST00000478502 750 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 SUPT4H1-206ENST00000581204 539 ntTSL 26.67□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 HAUS4-219ENST00000556421 851 ntTSL 24.42□□□□□ -1.71e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 40.3
SUB1P53999 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 40.3
SUB1P53999 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 40.3
SUB1P53999 ZNRD1-205ENST00000463141 571 ntTSL 28.47□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 40.3
SUB1P53999 ZNRD1-206ENST00000471008 3672 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 40.3
SUB1P53999 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 40.3
SUB1P53999 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.385e-8■■■■■ 40.3
SUB1P53999 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 40.2
SUB1P53999 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 40.2
SUB1P53999 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 40.2
SUB1P53999 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 40.2
SUB1P53999 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 40.2
SUB1P53999 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 40.2
SUB1P53999 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 40.2
SUB1P53999 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 40.2
SUB1P53999 SMC6-208ENST00000481708 3897 ntTSL 22.58□□□□□ -22e-6■■■■■ 40.2
SUB1P53999 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 210.68□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 40.2
SUB1P53999 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 37.71□□□□□ -1.183e-11■■■■■ 40.2
SUB1P53999 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 220.82■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 314.31□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 40.1
SUB1P53999 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 40.1
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 308.4 ms