RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264218.7

NMU-201, Transcript of neuromedin U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMU, Length 816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMU-201ENST00000264218 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.67■■■■□ 3.78
NMU-201ENST00000264218 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.29■■■■□ 3.08
NMU-201ENST00000264218 ABCC9O60706 1549 aa33.9■■■■□ 3.02
NMU-201ENST00000264218 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
NMU-201ENST00000264218 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.23■■■□□ 2.75
NMU-201ENST00000264218 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.22■■■□□ 2.75
NMU-201ENST00000264218 NACADO15069 1562 aa32.2■■■□□ 2.75
NMU-201ENST00000264218 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.03■■■□□ 2.72
NMU-201ENST00000264218 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.96■■■□□ 2.71
NMU-201ENST00000264218 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.76■■■□□ 2.67
NMU-201ENST00000264218 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.61■■■□□ 2.65
NMU-201ENST00000264218 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
NMU-201ENST00000264218 SCRIBQ14160 1630 aa31.37■■■□□ 2.61
NMU-201ENST00000264218 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.32■■■□□ 2.6
NMU-201ENST00000264218 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.88■■■□□ 2.53
NMU-201ENST00000264218 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.62■■■□□ 2.49
NMU-201ENST00000264218 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
NMU-201ENST00000264218 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.5■■■□□ 2.47
NMU-201ENST00000264218 SMARCA4P51532 1647 aa29.99■■■□□ 2.39
NMU-201ENST00000264218 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
NMU-201ENST00000264218 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.84■■■□□ 2.37
NMU-201ENST00000264218 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.8■■■□□ 2.36
NMU-201ENST00000264218 NCAPD3P42695 1498 aa29.73■■■□□ 2.35
NMU-201ENST00000264218 SMARCA2P51531 1590 aa29.71■■■□□ 2.35
NMU-201ENST00000264218 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.67■■■□□ 2.34
NMU-201ENST00000264218 HMGXB3Q12766 1538 aa29.6■■■□□ 2.33
NMU-201ENST00000264218 WIZO95785 1651 aa29.53■■■□□ 2.32
NMU-201ENST00000264218 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NMU-201ENST00000264218 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
NMU-201ENST00000264218 ERCC6Q03468 1493 aa29.25■■■□□ 2.27
NMU-201ENST00000264218 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
NMU-201ENST00000264218 CUX2O14529 1486 aa29.15■■■□□ 2.26
NMU-201ENST00000264218 NESP48681 1621 aa29.14■■■□□ 2.26
NMU-201ENST00000264218 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.1■■■□□ 2.25
NMU-201ENST00000264218 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.91■■■□□ 2.22
NMU-201ENST00000264218 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.87■■■□□ 2.21
NMU-201ENST00000264218 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.86■■■□□ 2.21
NMU-201ENST00000264218 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
NMU-201ENST00000264218 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
NMU-201ENST00000264218 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.8■■■□□ 2.2
NMU-201ENST00000264218 CFTRP13569 1480 aa28.74■■■□□ 2.19
NMU-201ENST00000264218 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.69■■■□□ 2.18
NMU-201ENST00000264218 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.56■■■□□ 2.16
NMU-201ENST00000264218 PRDM2Q13029 1718 aa28.51■■■□□ 2.15
NMU-201ENST00000264218 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.49■■■□□ 2.15
NMU-201ENST00000264218 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.46■■■□□ 2.15
NMU-201ENST00000264218 WDR62O43379 1518 aa28.41■■■□□ 2.14
NMU-201ENST00000264218 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
NMU-201ENST00000264218 TOPBP1Q92547 1522 aa28.13■■■□□ 2.09
NMU-201ENST00000264218 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.09■■■□□ 2.09
NMU-201ENST00000264218 ABCC8Q09428 1581 aa28.03■■■□□ 2.08
NMU-201ENST00000264218 CUX1P39880 1505 aa27.99■■■□□ 2.07
NMU-201ENST00000264218 TRIM41Q8WV44 630 aa27.93■■■□□ 2.06
NMU-201ENST00000264218 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NMU-201ENST00000264218 IFT140Q96RY7 1462 aa27.89■■■□□ 2.05
NMU-201ENST00000264218 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
NMU-201ENST00000264218 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
NMU-201ENST00000264218 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
NMU-201ENST00000264218 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.81■■■□□ 2.04
NMU-201ENST00000264218 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
NMU-201ENST00000264218 SYNJ1O43426 1573 aa27.78■■■□□ 2.04
NMU-201ENST00000264218 OSCARQ8IYS5 282 aa27.78■■■□□ 2.04
NMU-201ENST00000264218 SOGA1O94964 1423 aa27.75■■■□□ 2.03
NMU-201ENST00000264218 TOP2BQ02880 1626 aa27.74■■■□□ 2.03
NMU-201ENST00000264218 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.74■■■□□ 2.03
NMU-201ENST00000264218 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NMU-201ENST00000264218 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.024e-12■■■■■ 30.1
NMU-201ENST00000264218 WDR97A6NE52 1622 aa27.63■■■□□ 2.01
NMU-201ENST00000264218 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
NMU-201ENST00000264218 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.57■■■□□ 2
NMU-201ENST00000264218 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.55■■■□□ 2
NMU-201ENST00000264218 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.55■■■□□ 2
NMU-201ENST00000264218 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.55■■■□□ 2
NMU-201ENST00000264218 CHD1O14646 1710 aa27.49■■□□□ 1.99
NMU-201ENST00000264218 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.47■■□□□ 1.99
NMU-201ENST00000264218 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.44■■□□□ 1.98
NMU-201ENST00000264218 ARHGEF11O15085 1522 aa27.43■■□□□ 1.98
NMU-201ENST00000264218 GRIN2BQ13224 1484 aa27.41■■□□□ 1.98
NMU-201ENST00000264218 PBRM1Q86U86 1689 aa27.4■■□□□ 1.98
NMU-201ENST00000264218 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.4■■□□□ 1.98
NMU-201ENST00000264218 FBLN2P98095 1184 aa27.32■■□□□ 1.96
NMU-201ENST00000264218 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NMU-201ENST00000264218 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.22■■□□□ 1.95
NMU-201ENST00000264218 SYNJ2O15056 1496 aa27.22■■□□□ 1.95
NMU-201ENST00000264218 ADAMTS12P58397 1594 aa27.2■■□□□ 1.94
NMU-201ENST00000264218 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.18■■□□□ 1.94
NMU-201ENST00000264218 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
NMU-201ENST00000264218 KIF27Q86VH2 1401 aa27.17■■□□□ 1.94
NMU-201ENST00000264218 ARAP1Q96P48 1450 aa27.17■■□□□ 1.94
NMU-201ENST00000264218 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.12■■□□□ 1.93
NMU-201ENST00000264218 IGF1RP08069 1367 aa27.1■■□□□ 1.93
NMU-201ENST00000264218 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.1■■□□□ 1.93
NMU-201ENST00000264218 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.09■■□□□ 1.93
NMU-201ENST00000264218 GRIN2AQ12879 1464 aa27.07■■□□□ 1.92
NMU-201ENST00000264218 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.01■■□□□ 1.91
NMU-201ENST00000264218 CUL7Q14999 1698 aa26.99■■□□□ 1.91
NMU-201ENST00000264218 CEP170Q5SW79 1584 aa26.98■■□□□ 1.91
NMU-201ENST00000264218 NUP160Q12769 1436 aa26.96■■□□□ 1.91
NMU-201ENST00000264218 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.92■■□□□ 1.9
NMU-201ENST00000264218 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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