RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399672.5

C20orf27-203, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2

Gene C20orf27, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-203ENST00000399672 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.65■■■■■ 6.82
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C20orf27-203ENST00000399672 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.74■■■■■ 5.23
C20orf27-203ENST00000399672 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.5■■■■■ 5.19
C20orf27-203ENST00000399672 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.16■■■■■ 5.14
C20orf27-203ENST00000399672 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.07■■■■■ 5.13
C20orf27-203ENST00000399672 ABCC9O60706 1549 aa47.01■■■■■ 5.12
C20orf27-203ENST00000399672 NACADO15069 1562 aa46.65■■■■■ 5.06
C20orf27-203ENST00000399672 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.16■■■■■ 4.98
C20orf27-203ENST00000399672 SCRIBQ14160 1630 aa46.07■■■■■ 4.97
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C20orf27-203ENST00000399672 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.13■■■■■ 4.81
C20orf27-203ENST00000399672 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
C20orf27-203ENST00000399672 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.69■■■■■ 4.74
C20orf27-203ENST00000399672 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.65■■■■■ 4.74
C20orf27-203ENST00000399672 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
C20orf27-203ENST00000399672 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.5■■■■■ 4.71
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C20orf27-203ENST00000399672 SMARCA4P51532 1647 aa44.23■■■■■ 4.67
C20orf27-203ENST00000399672 WIZO95785 1651 aa44.15■■■■■ 4.66
C20orf27-203ENST00000399672 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.87■■■■■ 4.61
C20orf27-203ENST00000399672 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
C20orf27-203ENST00000399672 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.71■■■■■ 4.59
C20orf27-203ENST00000399672 SMARCA2P51531 1590 aa43.48■■■■■ 4.55
C20orf27-203ENST00000399672 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.43■■■■■ 4.54
C20orf27-203ENST00000399672 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
C20orf27-203ENST00000399672 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.3■■■■■ 4.52
C20orf27-203ENST00000399672 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
C20orf27-203ENST00000399672 NCAPD3P42695 1498 aa43.03■■■■■ 4.48
C20orf27-203ENST00000399672 HMGXB3Q12766 1538 aa43■■■■■ 4.47
C20orf27-203ENST00000399672 TRIM41Q8WV44 630 aa42.95■■■■■ 4.47
C20orf27-203ENST00000399672 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.58■■■■■ 4.41
C20orf27-203ENST00000399672 ABCC8Q09428 1581 aa42.43■■■■■ 4.38
C20orf27-203ENST00000399672 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.35
C20orf27-203ENST00000399672 CFTRP13569 1480 aa42.16■■■■■ 4.34
C20orf27-203ENST00000399672 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.15■■■■■ 4.34
C20orf27-203ENST00000399672 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
C20orf27-203ENST00000399672 PRDM2Q13029 1718 aa41.97■■■■■ 4.31
C20orf27-203ENST00000399672 SYNJ1O43426 1573 aa41.96■■■■■ 4.31
C20orf27-203ENST00000399672 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.96■■■■■ 4.31
C20orf27-203ENST00000399672 EEA1Q15075 1411 aa41.91■■■■■ 4.3
C20orf27-203ENST00000399672 TOP2BQ02880 1626 aa41.84■■■■■ 4.29
C20orf27-203ENST00000399672 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.78■■■■■ 4.28
C20orf27-203ENST00000399672 SOGA1O94964 1423 aa41.74■■■■■ 4.27
C20orf27-203ENST00000399672 CUX1P39880 1505 aa41.6■■■■■ 4.25
C20orf27-203ENST00000399672 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.58■■■■■ 4.25
C20orf27-203ENST00000399672 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.53■■■■■ 4.24
C20orf27-203ENST00000399672 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.51■■■■■ 4.24
C20orf27-203ENST00000399672 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.47■■■■■ 4.23
C20orf27-203ENST00000399672 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.39■■■■■ 4.22
C20orf27-203ENST00000399672 NESP48681 1621 aa41.36■■■■■ 4.21
C20orf27-203ENST00000399672 GOLGA3Q08378 1498 aa41.27■■■■■ 4.2
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C20orf27-203ENST00000399672 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.23■■■■■ 4.19
C20orf27-203ENST00000399672 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.22■■■■■ 4.19
C20orf27-203ENST00000399672 KIF27Q86VH2 1401 aa41.17■■■■■ 4.18
C20orf27-203ENST00000399672 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.17■■■■■ 4.18
C20orf27-203ENST00000399672 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.11■■■■■ 4.17
C20orf27-203ENST00000399672 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
C20orf27-203ENST00000399672 TOPBP1Q92547 1522 aa41.05■■■■■ 4.16
C20orf27-203ENST00000399672 CEP162Q5TB80 1403 aa40.97■■■■■ 4.15
C20orf27-203ENST00000399672 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.94■■■■■ 4.14
C20orf27-203ENST00000399672 CUX2O14529 1486 aa40.93■■■■■ 4.14
C20orf27-203ENST00000399672 PRXQ9BXM0 1461 aa40.93■■■■■ 4.14
C20orf27-203ENST00000399672 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.89■■■■■ 4.14
C20orf27-203ENST00000399672 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.89■■■■■ 4.14
C20orf27-203ENST00000399672 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
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C20orf27-203ENST00000399672 IGF1RP08069 1367 aa40.73■■■■■ 4.11
C20orf27-203ENST00000399672 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.69■■■■■ 4.1
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C20orf27-203ENST00000399672 CLIP1P30622 1438 aa40.61■■■■■ 4.09
C20orf27-203ENST00000399672 WDR97A6NE52 1622 aa40.57■■■■■ 4.09
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C20orf27-203ENST00000399672 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.39■■■■■ 4.06
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C20orf27-203ENST00000399672 ERCC6Q03468 1493 aa40.36■■■■■ 4.05
C20orf27-203ENST00000399672 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.33■■■■■ 4.05
C20orf27-203ENST00000399672 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.31■■■■■ 4.04
C20orf27-203ENST00000399672 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
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C20orf27-203ENST00000399672 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
C20orf27-203ENST00000399672 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
C20orf27-203ENST00000399672 ARAP1Q96P48 1450 aa40.1■■■■■ 4.01
C20orf27-203ENST00000399672 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
C20orf27-203ENST00000399672 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.05■■■■■ 4
C20orf27-203ENST00000399672 PBRM1Q86U86 1689 aa40.04■■■■■ 4
C20orf27-203ENST00000399672 APLP2Q06481 763 aa40.03■■■■■ 4
C20orf27-203ENST00000399672 GRIN2BQ13224 1484 aa39.99■■■■□ 3.99
C20orf27-203ENST00000399672 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.98■■■■□ 3.99
C20orf27-203ENST00000399672 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.998e-7■■■■■ 33.8
C20orf27-203ENST00000399672 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.93■■■■□ 3.98
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