RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505262.5

NMU-202, Transcript of neuromedin U, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NMU, Length 693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMU-202ENST00000505262 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.7■■■■■ 4.43
NMU-202ENST00000505262 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.32■■■■□ 3.73
NMU-202ENST00000505262 ABCC9O60706 1549 aa38.15■■■■□ 3.7
NMU-202ENST00000505262 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.37■■■■□ 3.41
NMU-202ENST00000505262 NACADO15069 1562 aa36.15■■■■□ 3.38
NMU-202ENST00000505262 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.9■■■■□ 3.34
NMU-202ENST00000505262 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.72■■■■□ 3.31
NMU-202ENST00000505262 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.72■■■■□ 3.31
NMU-202ENST00000505262 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.69■■■■□ 3.3
NMU-202ENST00000505262 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
NMU-202ENST00000505262 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
NMU-202ENST00000505262 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.38■■■■□ 3.25
NMU-202ENST00000505262 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.28■■■■□ 3.24
NMU-202ENST00000505262 SCRIBQ14160 1630 aa34.89■■■■□ 3.18
NMU-202ENST00000505262 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.83■■■■□ 3.17
NMU-202ENST00000505262 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.52■■■■□ 3.12
NMU-202ENST00000505262 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
NMU-202ENST00000505262 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.34■■■■□ 3.09
NMU-202ENST00000505262 NCAPD3P42695 1498 aa33.36■■■□□ 2.93
NMU-202ENST00000505262 SMARCA4P51532 1647 aa33.31■■■□□ 2.92
NMU-202ENST00000505262 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.28■■■□□ 2.92
NMU-202ENST00000505262 SMARCA2P51531 1590 aa33.19■■■□□ 2.9
NMU-202ENST00000505262 HMGXB3Q12766 1538 aa33.15■■■□□ 2.9
NMU-202ENST00000505262 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
NMU-202ENST00000505262 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.99■■■□□ 2.87
NMU-202ENST00000505262 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
NMU-202ENST00000505262 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.92■■■□□ 2.86
NMU-202ENST00000505262 ERCC6Q03468 1493 aa32.89■■■□□ 2.86
NMU-202ENST00000505262 NESP48681 1621 aa32.84■■■□□ 2.85
NMU-202ENST00000505262 CUX2O14529 1486 aa32.82■■■□□ 2.84
NMU-202ENST00000505262 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.69■■■□□ 2.82
NMU-202ENST00000505262 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.62■■■□□ 2.81
NMU-202ENST00000505262 WIZO95785 1651 aa32.56■■■□□ 2.8
NMU-202ENST00000505262 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
NMU-202ENST00000505262 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.49■■■□□ 2.79
NMU-202ENST00000505262 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.37■■■□□ 2.77
NMU-202ENST00000505262 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.33■■■□□ 2.77
NMU-202ENST00000505262 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
NMU-202ENST00000505262 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
NMU-202ENST00000505262 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.1■■■□□ 2.73
NMU-202ENST00000505262 WDR62O43379 1518 aa32.05■■■□□ 2.72
NMU-202ENST00000505262 CFTRP13569 1480 aa32.01■■■□□ 2.71
NMU-202ENST00000505262 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.99■■■□□ 2.71
NMU-202ENST00000505262 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.97■■■□□ 2.71
NMU-202ENST00000505262 PRDM2Q13029 1718 aa31.83■■■□□ 2.69
NMU-202ENST00000505262 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.74■■■□□ 2.67
NMU-202ENST00000505262 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
NMU-202ENST00000505262 TOPBP1Q92547 1522 aa31.4■■■□□ 2.62
NMU-202ENST00000505262 IFT140Q96RY7 1462 aa31.34■■■□□ 2.61
NMU-202ENST00000505262 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
NMU-202ENST00000505262 ABCC8Q09428 1581 aa31.31■■■□□ 2.6
NMU-202ENST00000505262 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.31■■■□□ 2.6
NMU-202ENST00000505262 OSCARQ8IYS5 282 aa31.31■■■□□ 2.6
NMU-202ENST00000505262 TRIM41Q8WV44 630 aa31.26■■■□□ 2.59
NMU-202ENST00000505262 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
NMU-202ENST00000505262 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
NMU-202ENST00000505262 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
NMU-202ENST00000505262 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.564e-12■■■■■ 30.1
NMU-202ENST00000505262 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.99■■■□□ 2.55
NMU-202ENST00000505262 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.99■■■□□ 2.55
NMU-202ENST00000505262 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.99■■■□□ 2.55
NMU-202ENST00000505262 CHD1O14646 1710 aa30.98■■■□□ 2.55
NMU-202ENST00000505262 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.97■■■□□ 2.55
NMU-202ENST00000505262 CUX1P39880 1505 aa30.92■■■□□ 2.54
NMU-202ENST00000505262 SOGA1O94964 1423 aa30.91■■■□□ 2.54
NMU-202ENST00000505262 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.9■■■□□ 2.54
NMU-202ENST00000505262 ARHGEF11O15085 1522 aa30.87■■■□□ 2.53
NMU-202ENST00000505262 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
NMU-202ENST00000505262 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
NMU-202ENST00000505262 WDR97A6NE52 1622 aa30.81■■■□□ 2.52
NMU-202ENST00000505262 FBLN2P98095 1184 aa30.75■■■□□ 2.51
NMU-202ENST00000505262 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.71■■■□□ 2.51
NMU-202ENST00000505262 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
NMU-202ENST00000505262 GRIN2BQ13224 1484 aa30.63■■■□□ 2.49
NMU-202ENST00000505262 PBRM1Q86U86 1689 aa30.63■■■□□ 2.49
NMU-202ENST00000505262 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.58■■■□□ 2.49
NMU-202ENST00000505262 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.57■■■□□ 2.49
NMU-202ENST00000505262 ARAP1Q96P48 1450 aa30.57■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.57■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.56■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.55■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 SYNJ1O43426 1573 aa30.54■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 SYNJ2O15056 1496 aa30.53■■■□□ 2.48
NMU-202ENST00000505262 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.49■■■□□ 2.47
NMU-202ENST00000505262 TOP2BQ02880 1626 aa30.46■■■□□ 2.47
NMU-202ENST00000505262 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
NMU-202ENST00000505262 ADAMTS12P58397 1594 aa30.29■■■□□ 2.44
NMU-202ENST00000505262 GRIN2AQ12879 1464 aa30.26■■■□□ 2.44
NMU-202ENST00000505262 CEP170Q5SW79 1584 aa30.19■■■□□ 2.42
NMU-202ENST00000505262 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.18■■■□□ 2.42
NMU-202ENST00000505262 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
NMU-202ENST00000505262 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.16■■■□□ 2.42
NMU-202ENST00000505262 NUP160Q12769 1436 aa30.16■■■□□ 2.42
NMU-202ENST00000505262 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.12■■■□□ 2.41
NMU-202ENST00000505262 SHROOM2Q13796 1616 aa30.07■■■□□ 2.4
NMU-202ENST00000505262 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.86■■■□□ 2.37
NMU-202ENST00000505262 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
NMU-202ENST00000505262 JPH4Q96JJ6 628 aa29.82■■■□□ 2.36
NMU-202ENST00000505262 IGF1RP08069 1367 aa29.8■■■□□ 2.36
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