Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL28P46779 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL28P46779 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL28P46779 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL28P46779 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL28P46779 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL28P46779 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL28P46779 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL28P46779 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL28P46779 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL28P46779 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL28P46779 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL28P46779 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms