Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDSP20132 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDSP20132 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDSP20132 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDSP20132 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDSP20132 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDSP20132 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDSP20132 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDSP20132 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDSP20132 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SDSP20132 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDSP20132 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDSP20132 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDSP20132 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDSP20132 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDSP20132 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDSP20132 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDSP20132 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDSP20132 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SDSP20132 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDSP20132 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDSP20132 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDSP20132 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDSP20132 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDSP20132 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDSP20132 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDSP20132 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDSP20132 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDSP20132 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDSP20132 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDSP20132 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDSP20132 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDSP20132 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDSP20132 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDSP20132 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDSP20132 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SDSP20132 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDSP20132 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms