Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNB2P17787 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB2P17787 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms