Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDP15428 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDP15428 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDP15428 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDP15428 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDP15428 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDP15428 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPGDP15428 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDP15428 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDP15428 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDP15428 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDP15428 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDP15428 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDP15428 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDP15428 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDP15428 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDP15428 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDP15428 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDP15428 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDP15428 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDP15428 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDP15428 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDP15428 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDP15428 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDP15428 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms