Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DMDP11532 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DMDP11532 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DMDP11532 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DMDP11532 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DMDP11532 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DMDP11532 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DMDP11532 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DMDP11532 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DMDP11532 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DMDP11532 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DMDP11532 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DMDP11532 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DMDP11532 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DMDP11532 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DMDP11532 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DMDP11532 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DMDP11532 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DMDP11532 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DMDP11532 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DMDP11532 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DMDP11532 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DMDP11532 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DMDP11532 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DMDP11532 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DMDP11532 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DMDP11532 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DMDP11532 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DMDP11532 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DMDP11532 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DMDP11532 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DMDP11532 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DMDP11532 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DMDP11532 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DMDP11532 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DMDP11532 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DMDP11532 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DMDP11532 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DMDP11532 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DMDP11532 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DMDP11532 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DMDP11532 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DMDP11532 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DMDP11532 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DMDP11532 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
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