Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GLI3P10071 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GLI3P10071 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GLI3P10071 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GLI3P10071 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GLI3P10071 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GLI3P10071 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GLI3P10071 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GLI3P10071 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
GLI3P10071 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
GLI3P10071 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
GLI3P10071 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GLI3P10071 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GLI3P10071 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GLI3P10071 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GLI3P10071 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GLI3P10071 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GLI3P10071 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GLI3P10071 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GLI3P10071 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GLI3P10071 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GLI3P10071 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GLI3P10071 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GLI3P10071 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GLI3P10071 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GLI3P10071 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GLI3P10071 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GLI3P10071 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GLI3P10071 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GLI3P10071 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GLI3P10071 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GLI3P10071 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GLI3P10071 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
GLI3P10071 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
GLI3P10071 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
GLI3P10071 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GLI3P10071 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GLI3P10071 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GLI3P10071 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GLI3P10071 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GLI3P10071 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GLI3P10071 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GLI3P10071 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GLI3P10071 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GLI3P10071 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GLI3P10071 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GLI3P10071 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GLI3P10071 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GLI3P10071 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GLI3P10071 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GLI3P10071 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GLI3P10071 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GLI3P10071 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GLI3P10071 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GLI3P10071 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GLI3P10071 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GLI3P10071 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GLI3P10071 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GLI3P10071 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GLI3P10071 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GLI3P10071 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
GLI3P10071 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
GLI3P10071 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GLI3P10071 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
GLI3P10071 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GLI3P10071 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GLI3P10071 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GLI3P10071 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GLI3P10071 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GLI3P10071 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GLI3P10071 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GLI3P10071 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GLI3P10071 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GLI3P10071 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GLI3P10071 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GLI3P10071 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GLI3P10071 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GLI3P10071 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GLI3P10071 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GLI3P10071 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GLI3P10071 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GLI3P10071 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GLI3P10071 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GLI3P10071 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GLI3P10071 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms