Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GLI2P10070 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GLI2P10070 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GLI2P10070 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GLI2P10070 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI2P10070 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI2P10070 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI2P10070 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI2P10070 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI2P10070 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GLI2P10070 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
GLI2P10070 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
GLI2P10070 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GLI2P10070 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GLI2P10070 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GLI2P10070 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GLI2P10070 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GLI2P10070 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GLI2P10070 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GLI2P10070 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GLI2P10070 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GLI2P10070 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GLI2P10070 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GLI2P10070 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GLI2P10070 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GLI2P10070 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GLI2P10070 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI2P10070 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GLI2P10070 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GLI2P10070 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GLI2P10070 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GLI2P10070 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GLI2P10070 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI2P10070 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI2P10070 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI2P10070 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI2P10070 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI2P10070 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI2P10070 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GLI2P10070 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
GLI2P10070 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GLI2P10070 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GLI2P10070 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
GLI2P10070 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GLI2P10070 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GLI2P10070 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GLI2P10070 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GLI2P10070 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GLI2P10070 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GLI2P10070 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
GLI2P10070 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GLI2P10070 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GLI2P10070 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI2P10070 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GLI2P10070 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GLI2P10070 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GLI2P10070 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GLI2P10070 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
GLI2P10070 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GLI2P10070 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI2P10070 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI2P10070 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI2P10070 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI2P10070 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI2P10070 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI2P10070 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI2P10070 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI2P10070 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI2P10070 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI2P10070 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI2P10070 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI2P10070 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI2P10070 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI2P10070 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms