Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN3O00409 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN3O00409 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms