Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01558Q9Y6Z2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01558Q9Y6Z2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01558Q9Y6Z2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01558Q9Y6Z2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01558Q9Y6Z2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01558Q9Y6Z2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01558Q9Y6Z2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01558Q9Y6Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01558Q9Y6Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01558Q9Y6Z2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01558Q9Y6Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC01558Q9Y6Z2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01558Q9Y6Z2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms