Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-204ENST00000561983 1044 ntTSL 525.74■■□□□ 1.719e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-209ENST00000563134 736 ntTSL 225.71■■□□□ 1.719e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-207ENST00000562708 672 ntTSL 523.75■■□□□ 1.399e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-216ENST00000567017 1094 ntTSL 523.75■■□□□ 1.399e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-214ENST00000566214 683 ntTSL 523.69■■□□□ 1.389e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 523.43■■□□□ 1.349e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-226ENST00000570280 708 ntTSL 321.24■□□□□ 0.999e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-205ENST00000562333 1052 ntTSL 520.81■□□□□ 0.929e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-210ENST00000563637 993 ntTSL 520.2■□□□□ 0.829e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-215ENST00000566965 879 ntTSL 518.8■□□□□ 0.69e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-211ENST00000563776 923 ntTSL 318.69■□□□□ 0.589e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-206ENST00000562598 612 ntTSL 316.82■□□□□ 0.289e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 516.52■□□□□ 0.249e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-224ENST00000569943 635 ntTSL 315.71■□□□□ 0.119e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-203ENST00000561929 625 ntTSL 214.24□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 44.4
UTP18Q9Y5J1 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-11■■■■■ 43.4
UTP18Q9Y5J1 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.255e-11■■■■■ 43.4
UTP18Q9Y5J1 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.73□□□□□ -1.495e-11■■■■■ 43.4
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 511.22□□□□□ -0.615e-13■■■■■ 42.8
UTP18Q9Y5J1 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 221.98■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 AATK-206ENST00000572798 407 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 C22orf24-202ENST00000486651 823 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 C22orf24-203ENST00000623735 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 218.15■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 STIM2-209ENST00000494628 726 ntTSL 514.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 40.7
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.375e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.295e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.565e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 VASP-208ENST00000589627 696 ntTSL 324.73■■□□□ 1.555e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 VASP-211ENST00000592139 424 ntTSL 323.67■■□□□ 1.385e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.075e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 VASP-210ENST00000590603 388 ntTSL 221.64■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 521.6■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 521.24■□□□□ 0.995e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-207ENST00000467724 826 ntTSL 520.67■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 NINL-206ENST00000489780 630 ntTSL 320.06■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 VASP-203ENST00000586619 655 ntTSL 219.7■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 218.79■□□□□ 0.65e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 418.7■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 516.95■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 216.66■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 416.47■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 416.13■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 NINL-204ENST00000461642 594 ntTSL 315.99■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 515.55■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 515.36■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-214ENST00000479185 2513 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 511.32□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-208ENST00000468796 540 ntTSL 49.28□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 AGAP3-217ENST00000480106 393 ntTSL 28.24□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 47.39□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-203ENST00000414670 500 ntTSL 36.78□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.375e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 45□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 42.77□□□□□ -1.975e-6■■■■■ 39.1
UTP18Q9Y5J1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-206ENST00000402641 669 ntTSL 319.02■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 416.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 415.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 38.8
UTP18Q9Y5J1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.73e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-220ENST00000530567 1415 ntTSL 222.93■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 521.32■■□□□ 13e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 13e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 320.27■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 319.5■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 317.9■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-214ENST00000528165 2828 ntTSL 216.03■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 315.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 314.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 2,623 protein–RNA pairs in 257.1 ms