RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589627.1

VASP-208, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene VASP, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASP-208ENST00000589627 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.21■■■■■ 7.07
VASP-208ENST00000589627 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.12■■■■■ 6.09
VASP-208ENST00000589627 ABCC9O60706 1549 aa52.5■■■■■ 6
VASP-208ENST00000589627 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.26■■■■■ 5.64
VASP-208ENST00000589627 NACADO15069 1562 aa50.03■■■■■ 5.6
VASP-208ENST00000589627 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.52■■■■■ 5.52
VASP-208ENST00000589627 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.48■■■■■ 5.51
VASP-208ENST00000589627 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.29■■■■■ 5.48
VASP-208ENST00000589627 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
VASP-208ENST00000589627 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.02■■■■■ 5.44
VASP-208ENST00000589627 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.86■■■■■ 5.41
VASP-208ENST00000589627 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.83■■■■■ 5.41
VASP-208ENST00000589627 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.83■■■■■ 5.41
VASP-208ENST00000589627 SCRIBQ14160 1630 aa48.28■■■■■ 5.32
VASP-208ENST00000589627 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.24■■■■■ 5.31
VASP-208ENST00000589627 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.56■■■■■ 5.2
VASP-208ENST00000589627 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
VASP-208ENST00000589627 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.28■■■■■ 5.16
VASP-208ENST00000589627 SMARCA4P51532 1647 aa46.16■■■■■ 4.98
VASP-208ENST00000589627 NCAPD3P42695 1498 aa46.12■■■■■ 4.97
VASP-208ENST00000589627 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.04■■■■■ 4.96
VASP-208ENST00000589627 SMARCA2P51531 1590 aa45.96■■■■■ 4.95
VASP-208ENST00000589627 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
VASP-208ENST00000589627 HMGXB3Q12766 1538 aa45.91■■■■■ 4.94
VASP-208ENST00000589627 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.76■■■■■ 4.92
VASP-208ENST00000589627 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.61■■■■■ 4.89
VASP-208ENST00000589627 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
VASP-208ENST00000589627 ERCC6Q03468 1493 aa45.29■■■■■ 4.84
VASP-208ENST00000589627 NESP48681 1621 aa45.25■■■■■ 4.83
VASP-208ENST00000589627 CUX2O14529 1486 aa45.19■■■■■ 4.82
VASP-208ENST00000589627 WIZO95785 1651 aa45.12■■■■■ 4.81
VASP-208ENST00000589627 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.09■■■■■ 4.81
VASP-208ENST00000589627 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
VASP-208ENST00000589627 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.82■■■■■ 4.77
VASP-208ENST00000589627 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
VASP-208ENST00000589627 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.7■■■■■ 4.75
VASP-208ENST00000589627 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.69■■■■■ 4.75
VASP-208ENST00000589627 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.59■■■■■ 4.73
VASP-208ENST00000589627 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
VASP-208ENST00000589627 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.34■■■■■ 4.69
VASP-208ENST00000589627 CFTRP13569 1480 aa44.33■■■■■ 4.69
VASP-208ENST00000589627 WDR62O43379 1518 aa44.29■■■■■ 4.68
VASP-208ENST00000589627 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.23■■■■■ 4.67
VASP-208ENST00000589627 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.21■■■■■ 4.67
VASP-208ENST00000589627 PRDM2Q13029 1718 aa44.13■■■■■ 4.66
VASP-208ENST00000589627 CCDC88BA6NC98 1476 aa44■■■■■ 4.63
VASP-208ENST00000589627 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
VASP-208ENST00000589627 TOPBP1Q92547 1522 aa43.45■■■■■ 4.55
VASP-208ENST00000589627 ABCC8Q09428 1581 aa43.37■■■■■ 4.53
VASP-208ENST00000589627 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.37■■■■■ 4.53
VASP-208ENST00000589627 IFT140Q96RY7 1462 aa43.34■■■■■ 4.53
VASP-208ENST00000589627 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
VASP-208ENST00000589627 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
VASP-208ENST00000589627 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
VASP-208ENST00000589627 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
VASP-208ENST00000589627 OSCARQ8IYS5 282 aa43.02■■■■■ 4.48
VASP-208ENST00000589627 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
VASP-208ENST00000589627 CUX1P39880 1505 aa42.85■■■■■ 4.45
VASP-208ENST00000589627 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.452e-7■■■■■ 29
VASP-208ENST00000589627 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.8■■■■■ 4.44
VASP-208ENST00000589627 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.8■■■■■ 4.44
VASP-208ENST00000589627 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
VASP-208ENST00000589627 SOGA1O94964 1423 aa42.74■■■■■ 4.43
VASP-208ENST00000589627 CHD1O14646 1710 aa42.74■■■■■ 4.43
VASP-208ENST00000589627 TRIM41Q8WV44 630 aa42.69■■■■■ 4.42
VASP-208ENST00000589627 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.61■■■■■ 4.41
VASP-208ENST00000589627 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.61■■■■■ 4.41
VASP-208ENST00000589627 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.61■■■■■ 4.41
VASP-208ENST00000589627 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
VASP-208ENST00000589627 ARHGEF11O15085 1522 aa42.48■■■■■ 4.39
VASP-208ENST00000589627 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.45■■■■■ 4.39
VASP-208ENST00000589627 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
VASP-208ENST00000589627 PBRM1Q86U86 1689 aa42.4■■■■■ 4.38
VASP-208ENST00000589627 GRIN2BQ13224 1484 aa42.39■■■■■ 4.38
VASP-208ENST00000589627 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.37■■■■■ 4.37
VASP-208ENST00000589627 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.36■■■■■ 4.37
VASP-208ENST00000589627 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.35■■■■■ 4.37
VASP-208ENST00000589627 FBLN2P98095 1184 aa42.31■■■■■ 4.36
VASP-208ENST00000589627 TOP2BQ02880 1626 aa42.31■■■■■ 4.36
VASP-208ENST00000589627 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.29■■■■■ 4.36
VASP-208ENST00000589627 SYNJ1O43426 1573 aa42.25■■■■■ 4.35
VASP-208ENST00000589627 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.23■■■■■ 4.35
VASP-208ENST00000589627 SYNJ2O15056 1496 aa42.23■■■■■ 4.35
VASP-208ENST00000589627 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.21■■■■■ 4.35
VASP-208ENST00000589627 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
VASP-208ENST00000589627 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
VASP-208ENST00000589627 ADAMTS12P58397 1594 aa41.97■■■■■ 4.31
VASP-208ENST00000589627 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.95■■■■■ 4.31
VASP-208ENST00000589627 GRIN2AQ12879 1464 aa41.87■■■■■ 4.29
VASP-208ENST00000589627 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.86■■■■■ 4.29
VASP-208ENST00000589627 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.77■■■■■ 4.28
VASP-208ENST00000589627 NUP160Q12769 1436 aa41.74■■■■■ 4.27
VASP-208ENST00000589627 CEP170Q5SW79 1584 aa41.74■■■■■ 4.27
VASP-208ENST00000589627 SHROOM2Q13796 1616 aa41.6■■■■■ 4.25
VASP-208ENST00000589627 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.54■■■■■ 4.24
VASP-208ENST00000589627 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.39■■■■■ 4.22
VASP-208ENST00000589627 KIF27Q86VH2 1401 aa41.37■■■■■ 4.21
VASP-208ENST00000589627 CUL7Q14999 1698 aa41.37■■■■■ 4.21
VASP-208ENST00000589627 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
VASP-208ENST00000589627 IGF1RP08069 1367 aa41.3■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.3 ms