RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413554.5

TNS1-204, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 1,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-204ENST00000413554 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.76■■■■□ 3
TNS1-204ENST00000413554 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.75■■■□□ 2.35
TNS1-204ENST00000413554 ABCC9O60706 1549 aa28.77■■■□□ 2.2
TNS1-204ENST00000413554 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TNS1-204ENST00000413554 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.08■■■□□ 2.09
TNS1-204ENST00000413554 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.95■■■□□ 2.07
TNS1-204ENST00000413554 NACADO15069 1562 aa27.93■■■□□ 2.06
TNS1-204ENST00000413554 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.93■■■□□ 2.06
TNS1-204ENST00000413554 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.83■■■□□ 2.05
TNS1-204ENST00000413554 SCRIBQ14160 1630 aa27.2■■□□□ 1.94
TNS1-204ENST00000413554 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.19■■□□□ 1.94
TNS1-204ENST00000413554 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.02■■□□□ 1.92
TNS1-204ENST00000413554 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
TNS1-204ENST00000413554 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.92■■□□□ 1.9
TNS1-204ENST00000413554 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.28■■□□□ 1.8
TNS1-204ENST00000413554 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TNS1-204ENST00000413554 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.13■■□□□ 1.77
TNS1-204ENST00000413554 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TNS1-204ENST00000413554 SMARCA4P51532 1647 aa26.07■■□□□ 1.76
TNS1-204ENST00000413554 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.03■■□□□ 1.76
TNS1-204ENST00000413554 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.03■■□□□ 1.76
TNS1-204ENST00000413554 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TNS1-204ENST00000413554 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.88■■□□□ 1.73
TNS1-204ENST00000413554 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.84■■□□□ 1.73
TNS1-204ENST00000413554 SMARCA2P51531 1590 aa25.82■■□□□ 1.72
TNS1-204ENST00000413554 NCAPD3P42695 1498 aa25.82■■□□□ 1.72
TNS1-204ENST00000413554 WIZO95785 1651 aa25.74■■□□□ 1.71
TNS1-204ENST00000413554 HMGXB3Q12766 1538 aa25.66■■□□□ 1.7
TNS1-204ENST00000413554 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
TNS1-204ENST00000413554 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TNS1-204ENST00000413554 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TNS1-204ENST00000413554 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.24■■□□□ 1.63
TNS1-204ENST00000413554 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.09■■□□□ 1.61
TNS1-204ENST00000413554 NESP48681 1621 aa25.03■■□□□ 1.6
TNS1-204ENST00000413554 CFTRP13569 1480 aa25.01■■□□□ 1.59
TNS1-204ENST00000413554 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25■■□□□ 1.59
TNS1-204ENST00000413554 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
TNS1-204ENST00000413554 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.75■■□□□ 1.55
TNS1-204ENST00000413554 PRDM2Q13029 1718 aa24.74■■□□□ 1.55
TNS1-204ENST00000413554 ERCC6Q03468 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
TNS1-204ENST00000413554 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.69■■□□□ 1.54
TNS1-204ENST00000413554 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
TNS1-204ENST00000413554 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.55■■□□□ 1.52
TNS1-204ENST00000413554 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TNS1-204ENST00000413554 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TNS1-204ENST00000413554 WDR62O43379 1518 aa24.45■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 ABCC8Q09428 1581 aa24.44■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 TOPBP1Q92547 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.39■■□□□ 1.49
TNS1-204ENST00000413554 CUX1P39880 1505 aa24.38■■□□□ 1.49
TNS1-204ENST00000413554 CUX2O14529 1486 aa24.34■■□□□ 1.49
TNS1-204ENST00000413554 SYNJ1O43426 1573 aa24.28■■□□□ 1.48
TNS1-204ENST00000413554 TOP2BQ02880 1626 aa24.27■■□□□ 1.48
TNS1-204ENST00000413554 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.24■■□□□ 1.47
TNS1-204ENST00000413554 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TNS1-204ENST00000413554 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.22■■□□□ 1.47
TNS1-204ENST00000413554 SOGA1O94964 1423 aa24.17■■□□□ 1.46
TNS1-204ENST00000413554 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.17■■□□□ 1.46
TNS1-204ENST00000413554 TRIM41Q8WV44 630 aa24.15■■□□□ 1.46
TNS1-204ENST00000413554 IFT140Q96RY7 1462 aa24.15■■□□□ 1.46
TNS1-204ENST00000413554 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.14■■□□□ 1.46
TNS1-204ENST00000413554 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TNS1-204ENST00000413554 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.03■■□□□ 1.44
TNS1-204ENST00000413554 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TNS1-204ENST00000413554 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TNS1-204ENST00000413554 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.431e-7■■■□□ 19.2
TNS1-204ENST00000413554 WDR97A6NE52 1622 aa23.96■■□□□ 1.43
TNS1-204ENST00000413554 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.88■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.85■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 KIF27Q86VH2 1401 aa23.85■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 GRIN2BQ13224 1484 aa23.81■■□□□ 1.4
TNS1-204ENST00000413554 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
TNS1-204ENST00000413554 IGF1RP08069 1367 aa23.77■■□□□ 1.4
TNS1-204ENST00000413554 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.73■■□□□ 1.39
TNS1-204ENST00000413554 PBRM1Q86U86 1689 aa23.71■■□□□ 1.39
TNS1-204ENST00000413554 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.69■■□□□ 1.38
TNS1-204ENST00000413554 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TNS1-204ENST00000413554 EEA1Q15075 1411 aa23.67■■□□□ 1.38
TNS1-204ENST00000413554 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.64■■□□□ 1.38
TNS1-204ENST00000413554 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.62■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.61■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 SYNJ2O15056 1496 aa23.6■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 ADAMTS12P58397 1594 aa23.58■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 FBLN2P98095 1184 aa23.58■■□□□ 1.37
TNS1-204ENST00000413554 CUL7Q14999 1698 aa23.56■■□□□ 1.36
TNS1-204ENST00000413554 PRXQ9BXM0 1461 aa23.52■■□□□ 1.36
TNS1-204ENST00000413554 GRIN2AQ12879 1464 aa23.49■■□□□ 1.35
TNS1-204ENST00000413554 CHD1O14646 1710 aa23.49■■□□□ 1.35
TNS1-204ENST00000413554 OSCARQ8IYS5 282 aa23.49■■□□□ 1.35
TNS1-204ENST00000413554 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.48■■□□□ 1.35
TNS1-204ENST00000413554 NUP160Q12769 1436 aa23.4■■□□□ 1.34
TNS1-204ENST00000413554 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
TNS1-204ENST00000413554 CEP170Q5SW79 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
TNS1-204ENST00000413554 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
TNS1-204ENST00000413554 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.28■■□□□ 1.32
TNS1-204ENST00000413554 GOLGA3Q08378 1498 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms