RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590603.1

VASP-210, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene VASP, Length 388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASP-210ENST00000590603 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.57■■■■■ 5.69
VASP-210ENST00000590603 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.19■■■■■ 4.83
VASP-210ENST00000590603 ABCC9O60706 1549 aa44.65■■■■■ 4.74
VASP-210ENST00000590603 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.8■■■■■ 4.44
VASP-210ENST00000590603 NACADO15069 1562 aa42.63■■■■■ 4.41
VASP-210ENST00000590603 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.5■■■■■ 4.39
VASP-210ENST00000590603 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.21■■■■■ 4.35
VASP-210ENST00000590603 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
VASP-210ENST00000590603 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.85■■■■■ 4.29
VASP-210ENST00000590603 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.69■■■■■ 4.26
VASP-210ENST00000590603 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.25
VASP-210ENST00000590603 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.4■■■■■ 4.22
VASP-210ENST00000590603 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.3■■■■■ 4.2
VASP-210ENST00000590603 SCRIBQ14160 1630 aa41.18■■■■■ 4.18
VASP-210ENST00000590603 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.09■■■■■ 4.17
VASP-210ENST00000590603 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
VASP-210ENST00000590603 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.36■■■■■ 4.05
VASP-210ENST00000590603 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.2■■■■■ 4.03
VASP-210ENST00000590603 SMARCA4P51532 1647 aa39.34■■■■□ 3.89
VASP-210ENST00000590603 NCAPD3P42695 1498 aa39.31■■■■□ 3.88
VASP-210ENST00000590603 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
VASP-210ENST00000590603 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.25■■■■□ 3.87
VASP-210ENST00000590603 SMARCA2P51531 1590 aa39.24■■■■□ 3.87
VASP-210ENST00000590603 HMGXB3Q12766 1538 aa39.09■■■■□ 3.85
VASP-210ENST00000590603 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.96■■■■□ 3.83
VASP-210ENST00000590603 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
VASP-210ENST00000590603 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.93■■■■□ 3.82
VASP-210ENST00000590603 ERCC6Q03468 1493 aa38.61■■■■□ 3.77
VASP-210ENST00000590603 WIZO95785 1651 aa38.48■■■■□ 3.75
VASP-210ENST00000590603 NESP48681 1621 aa38.45■■■■□ 3.75
VASP-210ENST00000590603 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.38■■■■□ 3.73
VASP-210ENST00000590603 CUX2O14529 1486 aa38.35■■■■□ 3.73
VASP-210ENST00000590603 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
VASP-210ENST00000590603 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.17■■■■□ 3.7
VASP-210ENST00000590603 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.16■■■■□ 3.7
VASP-210ENST00000590603 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
VASP-210ENST00000590603 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
VASP-210ENST00000590603 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.99■■■■□ 3.67
VASP-210ENST00000590603 CFTRP13569 1480 aa37.82■■■■□ 3.64
VASP-210ENST00000590603 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.77■■■■□ 3.64
VASP-210ENST00000590603 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.74■■■■□ 3.63
VASP-210ENST00000590603 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.72■■■■□ 3.63
VASP-210ENST00000590603 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.67■■■■□ 3.62
VASP-210ENST00000590603 WDR62O43379 1518 aa37.65■■■■□ 3.62
VASP-210ENST00000590603 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.63■■■■□ 3.61
VASP-210ENST00000590603 PRDM2Q13029 1718 aa37.47■■■■□ 3.59
VASP-210ENST00000590603 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
VASP-210ENST00000590603 ABCC8Q09428 1581 aa37.09■■■■□ 3.53
VASP-210ENST00000590603 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
VASP-210ENST00000590603 TOPBP1Q92547 1522 aa37.05■■■■□ 3.52
VASP-210ENST00000590603 IFT140Q96RY7 1462 aa36.98■■■■□ 3.51
VASP-210ENST00000590603 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.98■■■■□ 3.51
VASP-210ENST00000590603 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
VASP-210ENST00000590603 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
VASP-210ENST00000590603 OSCARQ8IYS5 282 aa36.67■■■■□ 3.46
VASP-210ENST00000590603 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
VASP-210ENST00000590603 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
VASP-210ENST00000590603 SOGA1O94964 1423 aa36.57■■■■□ 3.44
VASP-210ENST00000590603 CUX1P39880 1505 aa36.56■■■■□ 3.44
VASP-210ENST00000590603 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.55■■■■□ 3.44
VASP-210ENST00000590603 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.52■■■■□ 3.44
VASP-210ENST00000590603 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.448e-8■■■■■ 51.6
VASP-210ENST00000590603 WDR97A6NE52 1622 aa36.42■■■■□ 3.42
VASP-210ENST00000590603 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
VASP-210ENST00000590603 TRIM41Q8WV44 630 aa36.26■■■■□ 3.4
VASP-210ENST00000590603 FBLN2P98095 1184 aa36.25■■■■□ 3.39
VASP-210ENST00000590603 CHD1O14646 1710 aa36.23■■■■□ 3.39
VASP-210ENST00000590603 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
VASP-210ENST00000590603 GRIN2BQ13224 1484 aa36.21■■■■□ 3.39
VASP-210ENST00000590603 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.2■■■■□ 3.39
VASP-210ENST00000590603 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.18■■■■□ 3.38
VASP-210ENST00000590603 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
VASP-210ENST00000590603 TOP2BQ02880 1626 aa36.16■■■■□ 3.38
VASP-210ENST00000590603 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.14■■■■□ 3.38
VASP-210ENST00000590603 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.14■■■■□ 3.38
VASP-210ENST00000590603 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
VASP-210ENST00000590603 SYNJ1O43426 1573 aa36.09■■■■□ 3.37
VASP-210ENST00000590603 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.05■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 PBRM1Q86U86 1689 aa36.05■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 ARHGEF11O15085 1522 aa36.04■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 SYNJ2O15056 1496 aa36.03■■■■□ 3.36
VASP-210ENST00000590603 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.85■■■■□ 3.33
VASP-210ENST00000590603 ADAMTS12P58397 1594 aa35.76■■■■□ 3.32
VASP-210ENST00000590603 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.76■■■■□ 3.31
VASP-210ENST00000590603 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.75■■■■□ 3.31
VASP-210ENST00000590603 GRIN2AQ12879 1464 aa35.73■■■■□ 3.31
VASP-210ENST00000590603 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.72■■■■□ 3.31
VASP-210ENST00000590603 ARAP1Q96P48 1450 aa35.7■■■■□ 3.31
VASP-210ENST00000590603 NUP160Q12769 1436 aa35.57■■■■□ 3.29
VASP-210ENST00000590603 KIF27Q86VH2 1401 aa35.53■■■■□ 3.28
VASP-210ENST00000590603 CEP170Q5SW79 1584 aa35.52■■■■□ 3.28
VASP-210ENST00000590603 IGF1RP08069 1367 aa35.37■■■■□ 3.25
VASP-210ENST00000590603 CUL7Q14999 1698 aa35.35■■■■□ 3.25
VASP-210ENST00000590603 SHROOM2Q13796 1616 aa35.33■■■■□ 3.25
VASP-210ENST00000590603 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.26■■■■□ 3.24
VASP-210ENST00000590603 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.24■■■■□ 3.23
VASP-210ENST00000590603 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
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