RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592139.1

VASP-211, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene VASP, Length 424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASP-211ENST00000592139 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.15■■■■■ 6.58
VASP-211ENST00000592139 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.14■■■■■ 5.62
VASP-211ENST00000592139 ABCC9O60706 1549 aa49.92■■■■■ 5.58
VASP-211ENST00000592139 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.58■■■■■ 5.21
VASP-211ENST00000592139 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.35■■■■■ 5.17
VASP-211ENST00000592139 NACADO15069 1562 aa47.34■■■■■ 5.17
VASP-211ENST00000592139 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.77■■■■■ 5.08
VASP-211ENST00000592139 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
VASP-211ENST00000592139 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
VASP-211ENST00000592139 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.53■■■■■ 5.04
VASP-211ENST00000592139 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.51■■■■■ 5.04
VASP-211ENST00000592139 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.33■■■■■ 5.01
VASP-211ENST00000592139 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
VASP-211ENST00000592139 SCRIBQ14160 1630 aa45.83■■■■■ 4.93
VASP-211ENST00000592139 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.54■■■■■ 4.88
VASP-211ENST00000592139 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.06■■■■■ 4.8
VASP-211ENST00000592139 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
VASP-211ENST00000592139 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.89■■■■■ 4.78
VASP-211ENST00000592139 NCAPD3P42695 1498 aa43.72■■■■■ 4.59
VASP-211ENST00000592139 SMARCA4P51532 1647 aa43.72■■■■■ 4.59
VASP-211ENST00000592139 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.68■■■■■ 4.58
VASP-211ENST00000592139 SMARCA2P51531 1590 aa43.54■■■■■ 4.56
VASP-211ENST00000592139 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
VASP-211ENST00000592139 HMGXB3Q12766 1538 aa43.42■■■■■ 4.54
VASP-211ENST00000592139 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.32■■■■■ 4.52
VASP-211ENST00000592139 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
VASP-211ENST00000592139 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.24■■■■■ 4.51
VASP-211ENST00000592139 ERCC6Q03468 1493 aa43.05■■■■■ 4.48
VASP-211ENST00000592139 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
VASP-211ENST00000592139 WIZO95785 1651 aa42.8■■■■■ 4.44
VASP-211ENST00000592139 CUX2O14529 1486 aa42.77■■■■■ 4.44
VASP-211ENST00000592139 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
VASP-211ENST00000592139 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
VASP-211ENST00000592139 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.44■■■■■ 4.38
VASP-211ENST00000592139 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.43■■■■■ 4.38
VASP-211ENST00000592139 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
VASP-211ENST00000592139 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.4■■■■■ 4.38
VASP-211ENST00000592139 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.37■■■■■ 4.37
VASP-211ENST00000592139 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
VASP-211ENST00000592139 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.05■■■■■ 4.32
VASP-211ENST00000592139 CFTRP13569 1480 aa42.03■■■■■ 4.32
VASP-211ENST00000592139 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.98■■■■■ 4.31
VASP-211ENST00000592139 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.97■■■■■ 4.31
VASP-211ENST00000592139 WDR62O43379 1518 aa41.92■■■■■ 4.3
VASP-211ENST00000592139 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.81■■■■■ 4.28
VASP-211ENST00000592139 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
VASP-211ENST00000592139 PRDM2Q13029 1718 aa41.56■■■■■ 4.24
VASP-211ENST00000592139 TOPBP1Q92547 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
VASP-211ENST00000592139 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
VASP-211ENST00000592139 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
VASP-211ENST00000592139 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
VASP-211ENST00000592139 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
VASP-211ENST00000592139 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
VASP-211ENST00000592139 OSCARQ8IYS5 282 aa40.93■■■■■ 4.14
VASP-211ENST00000592139 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
VASP-211ENST00000592139 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
VASP-211ENST00000592139 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
VASP-211ENST00000592139 TRIM41Q8WV44 630 aa40.76■■■■■ 4.12
VASP-211ENST00000592139 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.118e-8■■■■■ 51.6
VASP-211ENST00000592139 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.71■■■■■ 4.11
VASP-211ENST00000592139 CUX1P39880 1505 aa40.67■■■■■ 4.1
VASP-211ENST00000592139 SOGA1O94964 1423 aa40.66■■■■■ 4.1
VASP-211ENST00000592139 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
VASP-211ENST00000592139 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.08
VASP-211ENST00000592139 FBLN2P98095 1184 aa40.43■■■■■ 4.06
VASP-211ENST00000592139 CHD1O14646 1710 aa40.42■■■■■ 4.06
VASP-211ENST00000592139 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
VASP-211ENST00000592139 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
VASP-211ENST00000592139 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
VASP-211ENST00000592139 WDR97A6NE52 1622 aa40.33■■■■■ 4.05
VASP-211ENST00000592139 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.32■■■■■ 4.05
VASP-211ENST00000592139 ARHGEF11O15085 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
VASP-211ENST00000592139 GRIN2BQ13224 1484 aa40.24■■■■■ 4.03
VASP-211ENST00000592139 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
VASP-211ENST00000592139 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.16■■■■■ 4.02
VASP-211ENST00000592139 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.16■■■■■ 4.02
VASP-211ENST00000592139 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
VASP-211ENST00000592139 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
VASP-211ENST00000592139 SYNJ1O43426 1573 aa40.08■■■■■ 4.01
VASP-211ENST00000592139 PBRM1Q86U86 1689 aa40.08■■■■■ 4.01
VASP-211ENST00000592139 TOP2BQ02880 1626 aa40.07■■■■■ 4.01
VASP-211ENST00000592139 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.06■■■■■ 4
VASP-211ENST00000592139 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.05■■■■■ 4
VASP-211ENST00000592139 SYNJ2O15056 1496 aa40.05■■■■■ 4
VASP-211ENST00000592139 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.01■■■■■ 4
VASP-211ENST00000592139 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.96■■■■□ 3.99
VASP-211ENST00000592139 ARAP1Q96P48 1450 aa39.93■■■■□ 3.98
VASP-211ENST00000592139 ADAMTS12P58397 1594 aa39.75■■■■□ 3.95
VASP-211ENST00000592139 GRIN2AQ12879 1464 aa39.72■■■■□ 3.95
VASP-211ENST00000592139 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.65■■■■□ 3.94
VASP-211ENST00000592139 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
VASP-211ENST00000592139 CEP170Q5SW79 1584 aa39.58■■■■□ 3.93
VASP-211ENST00000592139 NUP160Q12769 1436 aa39.57■■■■□ 3.93
VASP-211ENST00000592139 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.45■■■■□ 3.91
VASP-211ENST00000592139 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
VASP-211ENST00000592139 KIF27Q86VH2 1401 aa39.32■■■■□ 3.89
VASP-211ENST00000592139 SHROOM2Q13796 1616 aa39.32■■■■□ 3.88
VASP-211ENST00000592139 IGF1RP08069 1367 aa39.29■■■■□ 3.88
VASP-211ENST00000592139 JPH4Q96JJ6 628 aa39.2■■■■□ 3.87
VASP-211ENST00000592139 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
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