Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NRXN3Q9Y4C0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NRXN3Q9Y4C0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NRXN3Q9Y4C0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
NRXN3Q9Y4C0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
NRXN3Q9Y4C0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NRXN3Q9Y4C0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NRXN3Q9Y4C0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
NRXN3Q9Y4C0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NRXN3Q9Y4C0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NRXN3Q9Y4C0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
NRXN3Q9Y4C0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NRXN3Q9Y4C0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NRXN3Q9Y4C0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NRXN3Q9Y4C0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NRXN3Q9Y4C0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NRXN3Q9Y4C0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
NRXN3Q9Y4C0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NRXN3Q9Y4C0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NRXN3Q9Y4C0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NRXN3Q9Y4C0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NRXN3Q9Y4C0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
NRXN3Q9Y4C0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NRXN3Q9Y4C0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NRXN3Q9Y4C0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NRXN3Q9Y4C0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NRXN3Q9Y4C0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NRXN3Q9Y4C0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NRXN3Q9Y4C0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NRXN3Q9Y4C0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NRXN3Q9Y4C0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
NRXN3Q9Y4C0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NRXN3Q9Y4C0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NRXN3Q9Y4C0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
NRXN3Q9Y4C0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
NRXN3Q9Y4C0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NRXN3Q9Y4C0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NRXN3Q9Y4C0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NRXN3Q9Y4C0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NRXN3Q9Y4C0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
NRXN3Q9Y4C0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NRXN3Q9Y4C0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NRXN3Q9Y4C0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NRXN3Q9Y4C0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NRXN3Q9Y4C0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NRXN3Q9Y4C0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
NRXN3Q9Y4C0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
NRXN3Q9Y4C0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NRXN3Q9Y4C0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NRXN3Q9Y4C0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
NRXN3Q9Y4C0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NRXN3Q9Y4C0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
NRXN3Q9Y4C0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NRXN3Q9Y4C0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
NRXN3Q9Y4C0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NRXN3Q9Y4C0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NRXN3Q9Y4C0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41■■■■■ 4.15
NRXN3Q9Y4C0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NRXN3Q9Y4C0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NRXN3Q9Y4C0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NRXN3Q9Y4C0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NRXN3Q9Y4C0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
NRXN3Q9Y4C0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NRXN3Q9Y4C0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NRXN3Q9Y4C0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NRXN3Q9Y4C0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NRXN3Q9Y4C0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NRXN3Q9Y4C0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
NRXN3Q9Y4C0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
NRXN3Q9Y4C0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
NRXN3Q9Y4C0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NRXN3Q9Y4C0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NRXN3Q9Y4C0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
NRXN3Q9Y4C0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NRXN3Q9Y4C0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NRXN3Q9Y4C0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NRXN3Q9Y4C0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NRXN3Q9Y4C0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NRXN3Q9Y4C0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NRXN3Q9Y4C0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NRXN3Q9Y4C0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms