Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
THSD7AQ9UPZ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
THSD7AQ9UPZ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
THSD7AQ9UPZ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
THSD7AQ9UPZ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
THSD7AQ9UPZ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
THSD7AQ9UPZ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
THSD7AQ9UPZ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
THSD7AQ9UPZ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
THSD7AQ9UPZ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
THSD7AQ9UPZ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
THSD7AQ9UPZ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
THSD7AQ9UPZ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
THSD7AQ9UPZ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
THSD7AQ9UPZ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
THSD7AQ9UPZ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
THSD7AQ9UPZ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
THSD7AQ9UPZ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
THSD7AQ9UPZ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
THSD7AQ9UPZ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
THSD7AQ9UPZ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
THSD7AQ9UPZ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
THSD7AQ9UPZ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
THSD7AQ9UPZ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
THSD7AQ9UPZ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
THSD7AQ9UPZ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
THSD7AQ9UPZ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
THSD7AQ9UPZ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
THSD7AQ9UPZ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
THSD7AQ9UPZ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
THSD7AQ9UPZ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
THSD7AQ9UPZ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
THSD7AQ9UPZ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
THSD7AQ9UPZ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
THSD7AQ9UPZ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
THSD7AQ9UPZ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
THSD7AQ9UPZ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
THSD7AQ9UPZ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
THSD7AQ9UPZ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
THSD7AQ9UPZ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
THSD7AQ9UPZ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
THSD7AQ9UPZ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
THSD7AQ9UPZ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
THSD7AQ9UPZ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
THSD7AQ9UPZ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
THSD7AQ9UPZ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
THSD7AQ9UPZ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
THSD7AQ9UPZ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
THSD7AQ9UPZ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
THSD7AQ9UPZ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
THSD7AQ9UPZ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
THSD7AQ9UPZ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
THSD7AQ9UPZ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
THSD7AQ9UPZ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
THSD7AQ9UPZ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
THSD7AQ9UPZ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
THSD7AQ9UPZ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
THSD7AQ9UPZ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
THSD7AQ9UPZ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
THSD7AQ9UPZ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
THSD7AQ9UPZ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
THSD7AQ9UPZ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
THSD7AQ9UPZ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
THSD7AQ9UPZ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
THSD7AQ9UPZ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
THSD7AQ9UPZ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
THSD7AQ9UPZ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
THSD7AQ9UPZ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
THSD7AQ9UPZ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
THSD7AQ9UPZ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
THSD7AQ9UPZ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
THSD7AQ9UPZ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
THSD7AQ9UPZ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
THSD7AQ9UPZ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
THSD7AQ9UPZ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
THSD7AQ9UPZ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
THSD7AQ9UPZ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
THSD7AQ9UPZ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
THSD7AQ9UPZ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
THSD7AQ9UPZ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
THSD7AQ9UPZ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
THSD7AQ9UPZ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
THSD7AQ9UPZ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
THSD7AQ9UPZ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms