Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX6Q9UPM6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX6Q9UPM6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LHX6Q9UPM6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LHX6Q9UPM6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LHX6Q9UPM6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LHX6Q9UPM6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LHX6Q9UPM6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LHX6Q9UPM6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LHX6Q9UPM6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LHX6Q9UPM6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LHX6Q9UPM6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LHX6Q9UPM6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LHX6Q9UPM6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LHX6Q9UPM6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LHX6Q9UPM6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LHX6Q9UPM6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LHX6Q9UPM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LHX6Q9UPM6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LHX6Q9UPM6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LHX6Q9UPM6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LHX6Q9UPM6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LHX6Q9UPM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LHX6Q9UPM6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LHX6Q9UPM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LHX6Q9UPM6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LHX6Q9UPM6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LHX6Q9UPM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LHX6Q9UPM6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LHX6Q9UPM6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LHX6Q9UPM6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LHX6Q9UPM6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LHX6Q9UPM6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LHX6Q9UPM6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LHX6Q9UPM6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX6Q9UPM6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX6Q9UPM6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHX6Q9UPM6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LHX6Q9UPM6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LHX6Q9UPM6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LHX6Q9UPM6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LHX6Q9UPM6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX6Q9UPM6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX6Q9UPM6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LHX6Q9UPM6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LHX6Q9UPM6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX6Q9UPM6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LHX6Q9UPM6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LHX6Q9UPM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LHX6Q9UPM6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LHX6Q9UPM6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LHX6Q9UPM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LHX6Q9UPM6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX6Q9UPM6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX6Q9UPM6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX6Q9UPM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX6Q9UPM6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX6Q9UPM6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LHX6Q9UPM6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LHX6Q9UPM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LHX6Q9UPM6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX6Q9UPM6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LHX6Q9UPM6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LHX6Q9UPM6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX6Q9UPM6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms